安捷伦:新一代测序技术助力慢粒精准诊疗
9 月 22 日为国际慢粒日,“慢粒”即慢性髓性白血病或者慢性粒细胞白血病(CML),是一种血液和骨髓癌症,是白血病中较常见的一种类型,在我国约占白血病发病率的 15%。随着现代医学技术的发展,特别是靶向药物的出现,通过规范治疗和定期监测,慢性粒细胞白血病已经从“不治之症”转变为“可治、可控”,甚至可以“停药治疗”的疾病。
慢性粒细胞白血病的特点是会产生大量不成熟的白细胞,这些白细胞在骨髓内聚集,抑制骨髓的正常造血;并且能够通过血液在全身扩散,导致病人出现贫血、容易出血、感染及器官浸润等。慢性粒细胞白血病的病因仍未明确,但认为费城染色体与该病密切相关,大约有90% - 95% 的病人出现费城染色体(Ph1)。
Ph1 是 CML 的标志性染色体变化,由非随机 t(9;22)(q34;q11) 形成。在 9 号染色体断裂点上有 c-abl 基因,它的变异性可大于 100kb。bcr 基因位于 22 号染色体,是一个变异性很小的 5.8 kb DNA 小片段,易位后 22q- 和 9q 结合部形成 bcr/abl 融合基因,编码一个特异的 210 kb 蛋白质(P210),它是一种酪氨酸激酶,在肿瘤的发病中起作用。
电影《我不是药神》一度引起了社会共鸣,影片讲述的是由于治疗慢性粒细胞白血病的原研药过于昂贵,一位保健品店老板前往印度购置仿制药的故事。影片中被应用于治疗慢性粒细胞白血病的药物,是一种分子靶向药。普通的药物,通常在进入体内后只有一小部分能够真正的作用于病变部位。然而靶向药物的作用更像是一枚导弹,在进入人体后直接“瞄准”特定的位置积蓄或释放有效成分,从而有效且精准的治疗病变部位,并减少对正常组织的伤害。
然而,靶向药物的有效性是因人而异的。靶向药物之所以效果好、副作用低是因为它能针对特定的靶点发挥作用,而它的局限性也正是源于此。因为每个人的基因型都不尽相同,所以并不是每个人都具有靶向药物所针对的靶点。
那么,医学上该如何发现这些“靶点”呢?
使用靶向捕获测序技术,可以高效地将变异位点“抓”出来进行深度测序,从而实现对特定靶点的分析。在选择靶向药物之前,需要进行相应的基因检测,弄清楚患者体内的肿瘤细胞上是否有符合该靶向药物特定的位点,只有存在该敏感的位点,靶向药物才能真正的有的放矢。然而在长期的治疗过程中,肿瘤细胞对于药物也有可能会产生耐药性,这将导致靶向药物的效果明显下降。因此,同样也需要对耐药位点进行监测。
安捷伦科技致力于为客户最具挑战性的难题提供更可靠的答案。Glasgow 精准肿瘤实验室基于其安捷伦 SureSelect 靶向捕获技术,设计的 262 基因的专门针对于血液肿瘤的 Panel 可以很好地识别出肿瘤相关突变位点,为血液肿瘤的治疗提供用药依据。该 Panel 包含了 CNV、SNVs 以及 indel 的检测,同时可以提供微卫星不稳定性 MSI 和肿瘤突变负荷 TMB 的数据。
由于大多致病突变发生在基因外显子中,一系列大规模人群临床研究都揭示 WES 全外显子组测序技术是目前最简单高效基因检测技术。因此对于未明变异的慢粒疾病,可以通过全外显子组测序进行检测。
安捷伦 SureSelect 人全外显子 V7 设计精雕细琢、测序量低,是最经济有效的外显子组解决方案之一。采用人参考基因组序列版本 GRCh38/hg38* 来设计,带来最新基因组的独特优势。SureSelect 人全外显子 V7 靶向 RefSeq、GENCODE、CCDS 和 UCSC 已知基因数据库的蛋白质编码区域,以及 ACMG 指南包含的所有致病性变异,进行数据的二次挖掘。这项创新的捕获探针设计能以最少的测序量实现最大覆盖率。
(责任编辑:金利仪器lyh)